El tallo es rastrero, áspero, termina con zarcillos [5], que puede engancharse al soporte, extendiéndose al mismo tiempo en 1-2 m.la Planta también puede extenderse sobre el Suelo si no tiene soportes.
Las hojas son en forma de corazón, de cinco hojas.
El fruto es multi-semillero, jugoso, verde Esmeralda, denso, umbilical, en el medio natural también con pequeñas espinas (frutos criados artificialmente con un extracelular liso. La estructura del fruto es característica de la familia de las Calabazas y en la literatura botánica se define como calabaza. Puede tener diferentes formas y tamaños (dependiendo de la variedad). En términos culinarios, los pepinos se refieren tradicionalmente a vegetales populares.
El genoma del pepino sembrado se descifró completamente en 2009; cuenta con 350 millones de pares de bases de ADN. Cinco de los siete cromosomas de pepino se originaron a partir de diez cromosomas de ancestros comunes con melón[6].